Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms