Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms