Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms