Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms