Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD1Q8NBU5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD1Q8NBU5 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms