Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDZD4Q76G19 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms