Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM72Q6ZMU5 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms