Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q6P435 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q6P435 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6P435 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6P435 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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