Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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