Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT28

FAM27B, Protein FAM27A/B/C, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27BQ5VT28 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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