Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms