Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms