Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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