Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms