Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDRF1Q3B7T1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms