Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms