Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms