Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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