Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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