Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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COL9A3Q14050 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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COL9A3Q14050 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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COL9A3Q14050 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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COL9A3Q14050 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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COL9A3Q14050 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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