Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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