Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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