Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms