Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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