Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
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TCOF1Q13428 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCOF1Q13428 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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