Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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CHAF1BQ13112 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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CHAF1BQ13112 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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CHAF1BQ13112 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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CHAF1BQ13112 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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CHAF1BQ13112 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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