Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms