Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FOXD4Q12950 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FOXD4Q12950 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FOXD4Q12950 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FOXD4Q12950 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FOXD4Q12950 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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