Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP6Q0PNE2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP6Q0PNE2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP6Q0PNE2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP6Q0PNE2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP6Q0PNE2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP6Q0PNE2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP6Q0PNE2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP6Q0PNE2 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP6Q0PNE2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP6Q0PNE2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP6Q0PNE2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP6Q0PNE2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP6Q0PNE2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP6Q0PNE2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP6Q0PNE2 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP6Q0PNE2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP6Q0PNE2 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP6Q0PNE2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP6Q0PNE2 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP6Q0PNE2 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP6Q0PNE2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP6Q0PNE2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms