Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms