Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 LINC02006-202ENST00000492569 1958 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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TNP2Q05952 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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TNP2Q05952 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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TNP2Q05952 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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TNP2Q05952 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 TTC1-201ENST00000231238 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 CBR3-AS1-204ENST00000453159 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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