Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms