Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms