Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 PABPC5-202ENST00000373105 1262 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC012506.2-201ENST00000426527 533 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC053513.1-201ENST00000543604 738 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC007728.2-202ENST00000567728 1150 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 LINC02324-201ENST00000531609 1442 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC007278.1-201ENST00000450893 1327 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 BMP6P1-201ENST00000431230 679 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 RANBP6-202ENST00000485372 1000 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 METTL23-211ENST00000589977 617 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC036214.2-201ENST00000606512 917 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC027271.1-201ENST00000610270 610 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 ZNF761-205ENST00000613950 646 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC092683.1-202ENST00000620023 754 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC159540.2-201ENST00000621110 754 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC130448.1-201ENST00000624179 1733 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms