Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms