Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms