Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms