Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms