Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms