Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms