Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms