Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR7P32248 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR7P32248 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms