Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms