Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PLNP26678 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PLNP26678 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms