Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGA3P0DJD8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGA3P0DJD8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGA3P0DJD8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGA3P0DJD8 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGA3P0DJD8 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PGA3P0DJD8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGA3P0DJD8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGA3P0DJD8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGA3P0DJD8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGA3P0DJD8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGA3P0DJD8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGA3P0DJD8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGA3P0DJD8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGA3P0DJD8 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGA3P0DJD8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGA3P0DJD8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGA3P0DJD8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGA3P0DJD8 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGA3P0DJD8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGA3P0DJD8 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGA3P0DJD8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGA3P0DJD8 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGA3P0DJD8 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PGA3P0DJD8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGA3P0DJD8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PGA3P0DJD8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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