Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms