Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
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PRAMEF10O60809 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF10O60809 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF10O60809 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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PRAMEF10O60809 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PRAMEF10O60809 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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