Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COCHO43405 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COCHO43405 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COCHO43405 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COCHO43405 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COCHO43405 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COCHO43405 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COCHO43405 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COCHO43405 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COCHO43405 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COCHO43405 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COCHO43405 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COCHO43405 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COCHO43405 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COCHO43405 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COCHO43405 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COCHO43405 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COCHO43405 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COCHO43405 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COCHO43405 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COCHO43405 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COCHO43405 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COCHO43405 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COCHO43405 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COCHO43405 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COCHO43405 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COCHO43405 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COCHO43405 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COCHO43405 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COCHO43405 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COCHO43405 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COCHO43405 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COCHO43405 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COCHO43405 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COCHO43405 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COCHO43405 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COCHO43405 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COCHO43405 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COCHO43405 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COCHO43405 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COCHO43405 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COCHO43405 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COCHO43405 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COCHO43405 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COCHO43405 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COCHO43405 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COCHO43405 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms