Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms