Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms